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茶树紫黄素脱环氧化酶基因的cDNA克隆及其生物信息学分析
2021-02-23 12:11:00热度:163°C
根据GenBank中已登录的植物紫黄素脱环氧化酶(VDE)基因序列,以其高度保守的氨基酸序列设计一对简并引物,采用RT-PCR与3′/5′-RACE相结合的方法,从茶树(Camellia sinensi)中克隆出VDE的全长cDNA,长度为1632bp,分析表明,该序列的5′-端和3′-端的非编码序列长度分别为61bp和140bp,开放阅读框为1422bp,编码473个氨基酸。其转运肽长度为132个氨基酸。成熟蛋白的氨基酸序列与拟南芥,莴苣,菠菜及烟草的同源性分别为83.5%。82.7%,82.1%和83.6%。且有3个特殊的结构域;半胱氨酸富集区,脂肪结合蛋白特征区和由谷氨酸富集的高电荷区,分析表明,茶树VDE具有热稳定性。完成机构:安徽农业大学农业部茶叶生物技术重点开放实验室,安徽合肥230036
莲心茶叶上德若谷茶叶