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湖南茶树种质的遗传多样性、种群结构和核心种质基因分型测序分析
2022-03-28 03:38:52热度:120°C
茶被认为是一种众所周知和广泛消费的饮料，湖南省茶树种质资源丰富。为更好地保护和利用湖南茶树资源，通过7个产地的110份茶树材料的基因测序（GBS），对湖南茶树种质资源进行遗传多样性评估。结果，总共获得了311,044个高质量的单核苷酸多态性（SNP）标记。种群结构、系统发育关系和主成分分析（PCA）将整个种质分为三组。遗传多样性和群体分化分析表明，平均观察杂合度（Ho）范围为0.16~0.24，平均多态信息含量（PIC）范围为0.14~0.17，平均次要等位基因频率（MAF）范围为0.11~0.14 .分子方差分析（AMOVA）表明，81.38%的总方差来自种群内部，表明湖南茶种质资源具有丰富的遗传多样性。此外，还开发了一套核心茶种质资源集，由 22 种茶树种质组成，并保持了整个茶树种质的整体遗传多样性。该工作对湖南茶叶种质资源的保护和利用具有一定的参考价值。