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茶树幼根cDNA文库构建及其表达序列标签特性分析
2021-02-20 16:57:08热度:151°C
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茶树龙井43实生苗新生幼根为材料，应用pBluescript II XR cDNA Library Construction Kit，构建了我国第一个茶树幼根cDNA文库。测试结果表明原始文库的滴度为1．85×10^7pft/mL，重组率为85．7％，插入片段绝大多数分布在1．0-1．5kb左右。随机挑选5115个克隆进行序列测定，去除空载体和插入片段短于150bp的序列后，获得有效序列4833个，经过序列拼接后共获得3482条表达序列标签（expressed sequencetags，EST），包括901个contigs和2581个singletons。通过与NCBI等非冗余蛋白质数据库进行比对、查询和注释，获得已知功能基因或具推测功能的EST共1376个，代表943个茶树功能基因，421个EST为未知功能基因，1685个EST为新的表达基因。这些数据将为将为我们从分子水平上更好地了解、研究、调控茶树的生理代谢、生长发育和品质等提供极有价值的资源。
完成机构：中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心、国家茶树改良中心,杭州310008
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